沉井下沉時，有時會產生偏斜、下沉速渡過快或過慢等情形，此時應細心調查原因，調劑挖土次序和消除施工障礙，甚至借助卷揚機進行糾偏。沉井是靠自重下沉，要求井壁盡可能增添重量，并減少井壁和土層之間的摩擦力。磚、料石井壁的抗拉強度小，接縫多，整體性差，透水才能強；混凝土井壁整體性好，防水才能強，但抗拉強度低，下沉過程中輕易開裂滲水。排水方式依據水量大小，土質情形，裝備條件而定。水量不大，土質較好，一般采取簡易排水法或吊桶排水；水量較大，土質較差，應采用水泵抽水。

沉井井壁既是施工時擋土和防水的圍堰，又是構造外墻，所以要求井壁有足夠強度和抗滲性。在地層的側壓力和地下水的滲透壓力作用下，不致損壞變形或滲漏。排水封底能節儉大批混凝土，確保封底混凝土的強度和抗滲性，并能加快工程進度，省往水下封底混凝土的養護和抽水時光，故在地址條件允許的情形下，應盡量采用排水封底。刃腳內側的傾斜角度為45℃～60℃。一般踏面外形的穩固性好，但只實用于疏松而無障礙物的底層。刃腳上面的凹槽是在沉井封底后澆筑底板時，底板能和井壁緊密銜接，有利防水，有利于將封底地面反力更好地傳遞給井壁。一般凹槽高于1.0m，深度為150～300mm。

為了防止挖土下沉時井壁斷裂，沉井降落時要盡量做到均勻挖土，平衡下沉。但由于原始土質的不均勻性和挖土時的不平衡，所以井體在下沉進程中經常會產生不平衡，因此須要及時糾偏，通常采用挖土糾偏的措施。沉井下沉至設計標高后，應進行沉降觀測，待8h內累計下沉量不大于10mm時，方可進行封底。沉井封底時影響沉井防水后果的要害，封底有拍攝封底和不排水封底。（即干封底和水下封底）兩種方式。當下沉到后階段時，由于沉井井體很大部分進入土中，受土體側向約束作用，摩阻力增大，沉井將會出現下沉困難，而傾斜的可能性就很小了。

下沉通過粘土膠結層或沉井自身重力偏輕下沉困難時，可采用井外高壓射水、降低井內水位等方法下沉。在結構受力容許的條件下，亦可采用壓重或接高沉井下沉。對土質軟硬不均的土層，應先挖硬的一側，后挖軟的一側；對流砂層只挖中間不挖四周；對堅硬土層，可按撤除墊木先后順序分段掏空刃腳，并隨即回填砂礫，待幾段(即定位承墊木處)掏空并回填后，再分層逐步挖去回填填料，使均勻下沉。導管不能進水。混凝土面的終灌注高度，應比設計值高出150mm以上，待混凝土達到設計要求后，再抽水，鑿除表面松弱層。