凈化工程潔凈室之建筑主體構造，一般是用鋼筋或骨水泥，但無論是何種構造，必須滿足如下之條件：(1)不會因溫度變化與振動而發生裂痕。(2)不易產生微塵粒子，且很難附著粒子。(3)吸濕性小。(4)為了維持室內之濕度條件，熱絕緣性要高。進入潔凈區的空氣，經過初效(又稱粗效)、中效、三級過濾器過濾，使空氣達到所要求的潔凈級別。

凈化工程的設計中的注意事項：劃分和布置空調凈化和排風系統，選擇合理的空氣凈化通風設備。在水平流系統中，氣流是從一面墻流向另一面墻。在垂直流系統中，氣流是從吊頂流向地面。對要求潔凈室的懸浮粒子濃度或微生物濃度更低的場合，就使用單向氣流。大部分凈化廠房尤其電子工業用的潔凈廠房都有嚴格的恒溫、恒濕的要求，不僅對廠房內的溫、濕度有嚴格的要求，而且對溫度和相對濕度的波動范圍也有嚴格的要求。

凈化工程空調機房宜在潔凈室側面空調機房的位置，其位置宜在潔凈室的側面，這不但可以節能，也有利于風道的布置，并使氣流組織更加合理，同時，可以節省工程費用。凈化車間的檢測步驟，將凈化車間受測房間的溫度控制在設計溫度范圍內，并保持穩定。關閉并固定好房間圍護結構大部分的門、傳遞窗、周門和氣密閥等。凈化廠房地面可采用環氧自流坪地坪或耐磨塑料地板，有防靜電要求的，可選用防靜電型。 送回風管道用熱渡鋅板制成，貼凈化保溫效果好的阻燃型PF發泡塑膠板。